在临床工作中，医生经常会为病人进行各种各样的影像学检查。不少病人认为，磁共振成像检查比CT更先进，应该比CT更好，因此动辄要求医生给自己进行磁共振成像检查。其实，这是一个认识误区，CT和磁共振成像各有利弊。

计算机断层扫描(CT)就是用电脑分析加强的断层X线扫描，它的基本原理是X线，对骨头看得更清楚。CT分析的对象主要是组织密度不同产生的图像，例如骨头和软组织、空气等，是观察骨关节及软组织病变的一种较理想的检查方式。由于不同的软组织具有相似的密度，所以在CT扫描下没有太大的区别。

磁共振成像(MRI)是强力外加磁场引起人体中的氢原子产生共振，共振后氢原子产生的磁场经过扫描分析后成像，对软组织看得更清楚。在水和脂肪组织中的氢原子与其他原子的状态有很大区别，所以磁共振主要用来区分软组织，例如水和油。

磁共振与CT相比，没有离子辐射和碘过敏的顾虑，可以在不改变病人体位的情况下，形成多平面、多方向的图像，使病灶的定位更准确。相比之下，MRI检查的解剖分辨率更高，它可使血管直接显像并提供一定的病理和生化信息，使定性诊断更准确。MRI对脑部的白质病变、退行性病变及脊髓病变的诊断比CT优越得多。另外，CT检查不容易发现颅底、后颅窝的病变，MRI则相对不受这个限制。MRI检查的缺点是对骨骼病变、钙化病变显像不好，对于骨与软组织病变定性诊断无特异性，成像速度慢，检查耗时较长，费用也较高。在检查过程中，病人自主或不自主地活动可引起运动伪影，影响诊断。生命体征不稳定、精神异常、烦躁不合作、体内有金属异物（如起搏器、金属夹等）的病人，则不宜作MRI检查。

X线摄片、CT、磁共振成像可称为当前影像学检查的三驾马车，缺一不可。总的来说，CT和磁共振成像各有利弊，二者有机地结合，使当前影像学检查既扩大了检查范围，又提高了诊断水平。CT用来扫描大体的体内结构，例如，脑（中风时脑出血、中风后脑坏死在CT下显示都很清楚）、胸、腹部、盆腔、四肢（看骨头和软组织）、颈部等。而核磁共振则用来分析软组织，例如，某些特定疾病的脑组织、脊柱（脊髓）、四肢关节（主要看关节软组织)、体内脏器的肿瘤等更有优势。